本系現設有4間共同教室及7間教師個人實驗室，分別為「化學實驗教室」、「生物實驗教室」、「魚類營養及健康管理實驗室」、「箱網養殖實驗室」、「藻類生理生態實驗室」、「貝類培育實驗室」、「水族繁殖實驗室」、「魚類暨生物多樣性實驗室」、「甲殼類暨水族生態實驗室」 等。
另有「實驗器材準備室」、「藥品室」及「 室內及室外養殖場地」等設備，為教學、研究提供最佳場所。

藥品室(MS-306)

• 功能：存放實驗藥品
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟3樓

　

儀器設備名稱*數量	購入日期
電子秤(小數點後三位)*1	81/01/17
電子秤(小數點後四位)*2	86/12/06
導電度儀	90/11/30
導電度儀	102/04/08
PH儀*3	90/07/10
DO儀*1	90/07/10
DO儀*1	90/06/29
藥品櫃*2	92/01/27
藥品櫃*4	89/05/12

共用儀器室(MS-201)

• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟2樓

儀器設備名稱*數量	購入日期
分光光度計*2	81/06/03
可見光分光光譜儀*1	99/07/05
光學顯微鏡*2	100/07/21
解剖顯微鏡(含數位照相機)*2	87/05/18
分液收集器*1	90/12/17
電子秤(小數點後兩位)*2	98/03/13
導電度儀*1	90/12/17
溶氧儀*1	100/12/29
自動酵素免疫分析儀*1	90/12/31
電腦*1	98/02/28
電子目鏡*1	103/06/05

電子顯微鏡室(MS-303)

• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟3樓

儀器設備名稱*數量	購入日期
電子顯微鏡*1	102/09/23
電子防潮櫃*2	90/12/24
熱風循環烘箱*1	90/11/30

貴重儀器室(MS-208)

• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟2樓

儀器設備名稱*數量	購入日期
超低溫冷凍櫃*1	95/02/03
離心真空乾燥機*1	91/02/27
冷凍乾濃縮機*1	89/12/220
鈦冷水機*2	96/10/08

顯微鏡室/實驗器材準備室(MS-309)

• 功能：實驗用顯微鏡及基本實驗器材
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟3樓

儀器設備名稱*數量	購入日期
光學顯微鏡*21	81/04/24
光學顯微鏡*10	84/11/25
光學顯微鏡*20	85/12/21
光學顯微鏡*1	94/09/06
光學顯微鏡*2	97/10/15
光學顯微鏡*11	00/07/21
立體解剖顯微鏡*3	96/12/28
解剖顯微鏡*2	81/04/24
解剖顯微鏡*1	86/06/20
解剖顯微鏡*8	86/12/18
解剖顯微鏡*18	87/03/17
解剖顯微鏡*10	88/02/01
解剖顯微鏡*1	88/12/28
解剖顯微鏡*6	90/07/17
解剖顯微鏡*5	91/10/29
解剖顯微鏡*1	94/05/19
解剖顯微鏡*1	94/09/06
解剖顯微鏡*8	00/07/21
幻燈機*1	89/11/18
單槍投影機*1	95/06/20
彩色繪圖機*1	92/10/01
水質監測儀*1	83/06/18
會議桌*1	95/11/02
電腦*1	94/05/04
液晶投影機*	97/05/12

• 名稱：育苗場(FRP桶)
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側

儀器設備名稱*數量	購入日期
FRP桶*30	97/03/29

• 名稱：育苗場
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側

儀器設備名稱*數量	購入日期
餌料生物池*20	92/06/30

• 名稱：室內育苗場(溫室A)
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側

儀器設備名稱*數量	購入日期
室內育苗室1	88/07/31
FRP桶	97/03/29
監控攝影系統	101/08

• 名稱：室內自動化繁殖場(溫室B)
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側

儀器設備名稱*數量	購入日期
室內育苗室2	97/12/03
FRP桶	97/03/29
停電打氣系統
打氣機

• 名稱：室外養殖場
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側

儀器設備名稱*數量	購入日期
種魚池*1	92/06/30

• 名稱：200噸室外養殖場
• 管理人：張國亮 技士
• 設備所在位置：海洋科技大樓南棟後側